灵丹妙药不及你结局
大结局:大仇得报,终成眷属。
经历过种种事端,再加上依华的提醒,云归恢复了叶向时的记忆,他带着依华找到早已隐世的太师公,太师公曾教授过三个学生,一个是偷走半本药王手札的依华父亲,另一个是为人正派却遭灭门的叶士礼,还有一个是被他逐出师门的阴士昭。
云归想要太师公种植的美人面,装疯卖傻的太师公打了云归一顿,依华心疼的上前查看,太师公表示自己吃了谁的喜酒便把美人面送给谁,无奈之下云归跟依华举行了婚礼,如愿吃上喜酒的太师公把美人面给了云归,他偷偷告诉云归,自己早看出云归跟依华两情相悦,所以才成人之美的。拿到美人面的依华跟云归开始计划第二天告御状的事情,随后两人又浪漫的看起星星。
第二天云归醒来后发现自己浑身无力,而桌子上是依华留下的字条,为了保护云归,依华要一个人去找到寺庙进香的太后告御状,太师公感叹两人的深情便帮云归医治。另一边依华如愿见到太后,在官兵的威胁之下,胆大心细的依华将叶家灭门和阴士昭的计谋统统告诉给了太后,太后却觉得云归让依华只身前来是没担当的表现。身体好转的云归赶到寺庙,为了考验二人,太后让两人分别说出对方要活下去的原因,云归表示医者仁心的依华活着能救治更多的人,依华直言自己爱云归,所以她要云归活着。两人的话打动了太后,得到了面见皇上的机会。
本就因利而聚的罗英年和阴士昭倒戈相向,阴士昭派人杀罗英年失手后,罗英年将阴士昭制作银珠粉等罪证交给了秦月凝,秦月凝跟太师公一同来到朝堂之上。云归讲出自己当时受父亲叶士礼的指派到祥云县告知百姓美人面的毒性,却不想中途突闻家中噩耗,同时又被阴士昭的人追杀,阴士昭试图狡辩,却在云归和秦月凝的证据面前无法再掩饰。阴士昭的狼子野心让皇上十分震怒,命人将阴士昭关入打牢,同时为了嘉奖叶家的忠烈,皇上命云归入太医院任职并给予云归六品的官职,看着云归回归自己的真实身份,依华默默地离开。
得到医治的裴莺莺保住了性命却一直昏迷不醒,方程天在她床边告白希望她早日醒来,冥冥之中受到感动的裴莺莺醒了过来,确认了方程天真心的裴莺莺亲吻了方程天。云归终于明白依华为什么说两人根本不是一路人,为了跟依华在一起,云归决定回到慈华医馆。采药回来的依华看见云归既感动又心疼,两人对视时眼中都喊着泪水。